MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011259	TA	3	6	1674	1679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011259	AAT	2	6	1713	1718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011259	TA	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011259	TATTT	2	10	1729	1738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011259	TAA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011259	TATT	2	8	1793	1800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	TTA	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011259	ATT	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011259	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011259	ACTT	2	8	2813	2820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011259	AGT	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	TGA	2	6	2872	2877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011259	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011259	TAT	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011259	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011259	TTG	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011259	AAGA	2	8	3061	3068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011259	T	6	6	3148	3153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011259	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011259	T	8	8	3219	3226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011259	AAC	2	6	3227	3232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011259	ATT	3	9	3244	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011259	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011259	ATGT	2	8	3302	3309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011259	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011259	AAT	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011259	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011259	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011259	ATA	2	6	3419	3424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011259	TA	4	8	3438	3445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011259	ATC	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011259	AT	5	10	5897	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011259	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	A	6	6	5918	5923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011259	A	6	6	5945	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011259	TTTAAT	2	12	5961	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011259	T	6	6	5972	5977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011259	ATTTT	2	10	6044	6053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011259	T	7	7	6050	6056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011259	A	6	6	6060	6065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011259	ACT	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011259	GTT	2	6	6132	6137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	AT	3	6	6202	6207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	AATT	2	8	6236	6243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011259	TA	3	6	7626	7631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	GTT	2	6	7652	7657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	TTGT	2	8	7685	7692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	TAA	2	6	7707	7712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011259	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011259	AGT	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011259	T	6	6	7777	7782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011259	TTA	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	GT	3	6	7868	7873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011259	ATA	2	6	7886	7891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011259	A	7	7	7914	7920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011259	TA	3	6	7921	7926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011259	A	6	6	7926	7931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011259	CAA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011259	TAG	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011259	ACT	4	12	8012	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011259	AAAT	2	8	8071	8078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011259	AT	3	6	8093	8098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011259	TA	3	6	8153	8158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011259	TTA	2	6	8159	8164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011259	TTAA	2	8	8177	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011259	AGAT	2	8	8189	8196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011259	ATTA	2	8	8203	8210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011259	AAG	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011259	AT	3	6	8229	8234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011259	TTTA	2	8	8268	8275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011259	TGT	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011259	TAT	2	6	8311	8316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011259	GTA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011259	TTA	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011259	A	6	6	8452	8457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011259	AT	3	6	8492	8497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011259	CAA	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011259	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011259	TTA	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011259	AT	3	6	8596	8601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011259	TAATA	2	10	8606	8615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011259	TTA	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011259	ATTTTA	2	12	8666	8677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011259	AT	3	6	8719	8724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011259	ATT	3	9	8728	8736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011259	AG	3	6	8781	8786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011259	TTTAA	2	10	8804	8813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011259	AAGTA	2	10	8823	8832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011259	TTGT	2	8	8838	8845	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011259	TAT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011259	ACT	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011259	TAATAT	2	12	8924	8935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011259	T	6	6	8935	8940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011259	T	8	8	8942	8949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011259	AT	5	10	8958	8967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011259	TAT	2	6	8974	8979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011259	TTTA	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011259	TTAAAT	2	12	10341	10352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011259	ATT	2	6	10354	10359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011259	TAA	2	6	10423	10428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011259	AATT	2	8	10482	10489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011259	T	6	6	10488	10493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011259	A	6	6	10494	10499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011259	ATAA	2	8	10542	10549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011259	T	7	7	10564	10570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011259	T	6	6	10577	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011259	TTAT	2	8	10607	10614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011259	TATT	3	12	10619	10630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011259	ATTA	2	8	10637	10644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011259	AGATA	2	10	10676	10685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011259	A	7	7	10690	10696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011259	TA	3	6	10704	10709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011259	GA	4	8	10731	10738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011259	AG	3	6	10748	10753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011259	AG	3	6	10760	10765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011259	TGG	3	9	10792	10800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011259	TGA	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011259	GGA	2	6	10818	10823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011259	AAT	2	6	10863	10868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011259	AG	3	6	11016	11021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011259	AGA	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011259	G	7	7	11133	11139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011259	TAA	2	6	11209	11214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011259	GGT	2	6	11245	11250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011259	AAG	2	6	11255	11260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011259	CTA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011259	GA	3	6	11292	11297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011259	TGCT	2	8	11322	11329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011259	ATG	2	6	11337	11342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011259	AAC	2	6	11349	11354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011259	GCA	3	9	11360	11368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011259	GCA	2	6	11468	11473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011259	AAAG	2	8	11524	11531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011259	AGG	2	6	11545	11550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011259	ATTA	2	8	11558	11565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011259	AAT	2	6	11570	11575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011259	CT	3	6	11598	11603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011259	T	7	7	11603	11609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011259	TA	3	6	11623	11628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011259	TGA	2	6	11632	11637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011259	ATC	2	6	11654	11659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011259	T	6	6	11670	11675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011259	GTTT	2	8	11676	11683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011259	A	7	7	11699	11705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011259	A	6	6	11707	11712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011259	AGG	2	6	11715	11720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011259	AG	3	6	12872	12877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011259	AAG	2	6	12997	13002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011259	TA	3	6	14328	14333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_011259	ATA	2	6	21027	21032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011259	ATT	2	6	21039	21044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011259	ATA	2	6	21048	21053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011259	AATT	2	8	21061	21068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_011259	TTAG	2	8	21080	21087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
304	NC_011259	CT	3	6	21108	21113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
305	NC_011259	T	6	6	21113	21118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011259	TAT	2	6	21132	21137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_011259	TCAT	3	12	21151	21162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
308	NC_011259	TGT	2	6	21163	21168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
309	NC_011259	AGA	2	6	21201	21206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_011259	TAAA	2	8	21214	21221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_011259	A	8	8	21219	21226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_011259	AGG	2	6	21228	21233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011259	CTT	2	6	21246	21251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_011259	ATT	2	6	21287	21292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_011259	TGC	2	6	21328	21333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_011259	GCT	3	9	21411	21419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_011259	CAT	2	6	21487	21492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_011259	TATCT	2	10	21539	21548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
319	NC_011259	TAC	2	6	21575	21580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
320	NC_011259	AAT	2	6	21606	21611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_011259	CTTT	2	8	21638	21645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
322	NC_011259	TCT	2	6	21657	21662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_011259	CAG	2	6	21694	21699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_011259	ATA	2	6	21745	21750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_011259	TAA	2	6	21757	21762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_011259	TC	3	6	21782	21787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
327	NC_011259	GAGG	2	8	21798	21805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
328	NC_011259	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
329	NC_011259	TAA	2	6	21851	21856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_011259	GAA	2	6	21934	21939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
331	NC_011259	A	6	6	21979	21984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_011259	TA	3	6	22026	22031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_011259	A	6	6	22042	22047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_011259	TTA	2	6	22118	22123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_011259	AAAT	2	8	22131	22138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_011259	A	8	8	22158	22165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_011259	AT	3	6	22193	22198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_011259	A	6	6	22207	22212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_011259	GTAT	2	8	22229	22236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
340	NC_011259	TAA	2	6	22257	22262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_011259	GAA	2	6	22384	22389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
342	NC_011259	AATA	2	8	22396	22403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_011259	AAT	2	6	22472	22477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_011259	T	7	7	22489	22495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_011259	AAAT	2	8	22499	22506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_011259	GAT	3	9	22562	22570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
349	NC_011259	GTAA	2	8	22573	22580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
350	NC_011259	T	8	8	22613	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_011259	ATA	2	6	22632	22637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_011259	AGA	2	6	22645	22650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
353	NC_011259	TAA	2	6	22716	22721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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356	NC_011259	T	7	7	22782	22788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_011259	T	7	7	22798	22804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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359	NC_011259	T	7	7	22811	22817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_011259	A	6	6	22854	22859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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368	NC_011259	T	6	6	22967	22972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
369	NC_011259	A	7	7	22990	22996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.